Эта территория является особой зоной с уникальным режимом охраны, созданной для сохранения экосистемы озера Байкал.

Данные Государственного лесного реестра раскрывают структуру лесного покрова этого заповедного региона.Общая площадь лесного фонда республики составляет 27,07 млн га, из которых 13,6 млн га расположено в границах Байкальской природной территории.

Лесной растительностью здесь покрыто 11,06 млн га, или 81,3%. Распространено мнение, что главной лесообразующей породой в Бурятии является сосна, однако данные доказывают обратное: на Байкальской природной территории абсолютно доминирует лиственница, занимая 43,5% покрытой лесом площади. Сосна обыкновенная находится на втором месте с долей 38,8%.

Хвойные породы формируют основу лесов Байкальской природной территории, составляя 73,6% всего лесного покрова. Помимо лиственницы и сосны, здесь широко представлены кедр — 12,7%, пихта — 3,3% и ель — 1,7%. Средний возраст этих ценных хвойных насаждений достигает 112 лет. Мягколиственные леса, где преобладают берёза и осина, занимают 13,6% площади и значительно моложе — их средний возраст составляет 40 лет.

Эти точные данные о породном составе и возрасте лесов являются основой для планирования всего комплекса охранных и защитных мероприятий, направленных на сохранение уникальной экосистемы озера Байкал.