Министр
«Здравоохранение начало стремительно меняться в 2019 году. Так сказать, подросли региональные клиники, и в наш центр стали направлять более тяжелые категории больных, вышли новые требования к контролю качества медицинской помощи, перед нами поставили новые задачи по развитию региональных систем здравоохранения, подготовке кадров и многое другое, — отметил Чернявский. — Мы являемся национальным медицинским исследовательским центром по профилю „сердечно-сосудистая хирургия“ и теперь несем ответственность за 27 российских регионов. Центр должен также быстро меняться и реагировать на отраслевые нововведения и требования».
Чернявский стал и.о. директора после увольнения главы НМИЦ Александра Караськова.
В мае 2019 года Караськова уволили с поста директора клиники Мешалкина, которой он руководил 20 лет. На майской сессии заксобрания он сложил полномочия депутата — формальной причиной он назвал незадекларированный по ошибке дом. Врач возглавлял список «Единой России» на выборах в 2015 году.
На Александра Караськова и его супругу Ирину Бойцову завели дело по ч. 4 ст. 160 УК РФ (растрата) и ч. 5 ст. 33, ч. 4 ст. 160 УК РФ (пособничество в растрате). У самого Караськова на фоне этих событий произошел сердечный приступ и в зал суда его привезли из больницы.
Утром в день избрания меры пресечения защита Караськова опубликовала его открытое письмо
Кроме того, в феврале 2019 году замдиректора клиники Мешалкина Евгения Покушалова обвинили в мошенничестве (ч. 4 ст. 159 УК РФ) и легализации средств (ч. 4 ст. 174.1 УК РФ), сначала он был помещен в СИЗО, позже его отправили под домашний арест. Сообщалось об ущербе порядка 1,3 млрд рублей. Подозреваемыми также стали совладельцы ООО «Фаворит», поставлявшего медикаменты для больницы, Евгений Первушин и Александр Сорокин, а также Андрей Третьяков. В феврале 2020 года Покушалова отпустили под подписку о невыезде.